Pięć głównych natur chakry jest również nazwami pięciu wielkich nacji shinobi:
Katon, czyli sztuka manipulowania ogniem.
Suiton, czyli sztuka manipulowania wodą.
Doton, czyli sztuka manipulowania ziemią.
Raiton, czyli sztuka manipulowania błyskawicą.
Fuuton, czyli sztuka manipulowania wiatrem.
Działanie żywiołów:
Katon > Fuuton > Raïton > Dôton > Suiton > Katon...
W skrócie, ogień pokonuje wiatr, wiatr błyskawicę, błyskawica ziemię, ziemia wodę, woda ogień itd. Jednakże podczas walki brana jest też pod uwagę ranga techniki - np. silne jutsu związane z Raitonem pokona słabsze Fuutonu.
Zaawansowane żywioły:
Hyôton - Suiton + Fuuton, sztuka manipulowania lodem.
Hikariton - Raiton + Katon, sztuka manipulowania światłem.
Mokuton - Doton + Suiton, sztuka manipulowania drewnem.
Sunaton - sztuka manipulowania piaskiem.
Shôton - sztuka manipulowania kryształem.
Haton - Raiton + Fuuton, sztuka manipulowania szybkością.
Futton - Katon + Suiton, sztuka manipulowania parą.
Kinton - Doton + Raiton, sztuka manipulowania metalem.
Każdy shinobi posiada jeden, podstawowy żywioł chakry. Po pewnym czasie możliwe jest poznanie drugiego odpowiadającego nam żywiołu. Trzema władają tylko najpotężniejsi shinobi.